الفرق بين ميكروأري و رنا التسلسل | ميكروأري مقابل تسلسل الحمض النووي الريبي

الفرق الرئيسي - ميكروأري مقابل تسلسل الحمض النووي الريبي

ترانسكريبتوم يمثل المحتوى الكامل من الحمض النووي الريبي الموجودة في خلية بما في ذلك مرنا، رنا، الحمض الريبي النووي النقال، الحمض الريبي النووي النقال المتدهورة، و رنا غير المتداولة. التنميط ترانسكريبتوم هو عملية هامة من أجل فهم رؤى الخلية. هناك عدة طرق متقدمة لتنميط ترانسكريبتوم. ميكروأري وتسلسل الحمض النووي الريبي نوعان من التقنيات المتقدمة لتحليل ترانسكريبتوم. والفرق الرئيسي بين ميكروأري والتسلسل الحمض النووي الريبي هو أن ميكروأري يقوم على إمكانية التهجين من تحقيقات المسمى المسبق مع تسلسل كدنا الهدف في حين يستند تسلسل الحمض النووي الريبي على التسلسل المباشر من خيوط [كدنا] من خلال تقنيات التسلسل المتقدمة مثل نغس. يتم تنفيذ ميكروأري مع معرفة مسبقة عن تسلسل ويتم تنفيذ تسلسل الحمض النووي الريبي دون معرفة مسبقة عن تسلسل.

المحتويات

1. نظرة عامة والفرق الرئيسي

2. ما هو ميكروأري

3. ما هو تسلسل الحمض النووي الريبي

4. جنبا إلى جنب مقارنة - ميكروأري مقابل تسلسل الحمض النووي الريبي

5. ملخص

ما هو ميكروأري؟

ميكروأري هو طريقة قوية وموثوقة وعالية الإنتاجية المستخدمة في التنميط ترانسكريبتوم من قبل العلماء. هذا هو النهج الأكثر شعبية لتحليل النص. وهي طريقة منخفضة التكلفة، والتي تعتمد على تحقيقات التهجين.

تبدأ هذه التقنية باستخراج مرنا من العينة وبناء مكتبة [كدنا] من إجمالي الحمض النووي الريبي. ثم يتم خلطه مع تحقيقات مسبقة التحديد فلورزنتلي المسمى على سطح صلب (مصفوفة بقعة). التتابعات التكميلية تهجين مع تحقيقات المسمى في ميكروأري. ثم يتم غسلها ميكروأري وفحصها، ويتم تحديد الصورة كميا. وينبغي تحليل البيانات المجمعة للحصول على ملامح التعبير النسبي.

يفترض أن تكون شدة مجسات الميكروأري متناسبة مع كمية النصوص في العينة. ومع ذلك، فإن دقة تقنية تعتمد على تحقيقات مصممة، معرفة مسبقة من تسلسل وقرب من تحقيقات التهجين. وبالتالي التكنولوجيا ميكروأري لديها قيود. تقنية ميكروأري لا يمكن أن يؤديها مع النصوص وفرة منخفضة. فإنه يفشل في التفريق بين الأشكال الإسوية وتحديد المتغيرات الوراثية. وبما أن هذا الأسلوب يعتمد على التهجين من تحقيقات، بعض المشاكل المتعلقة التهجين مثل عبر التهجين، التهجين غير محددة الخ.يحدث في تقنية ميكروأري.

الشكل 01: ميكروأري

ما هو تسلسل الحمض النووي الريبي؟

رنا تسلسل بندقية (رنا التتابع ) هو تطور مؤخرا ترانسكريبتوم تقنية التسلسل. انها طريقة إنتاج سريعة وعالية من التنميط ترانسكريبتوم. فإنه يحدد بشكل مباشر التعبير عن الجينات والنتائج في التحقيق العميق لل ترانسكريبتوم. رنا تتابع لا تعتمد على تحقيقات مسبقة أو معرفة مسبقة من تسلسل. لذلك، الأسلوب رنا سيق، لديه حساسية عالية والقدرة على الكشف عن الجينات الجديدة والمتغيرات الوراثية.

يتم تنفيذ طريقة تسلسل الحمض النووي الريبي عبر عدة خطوات. يجب عزل الرنا الكلي للخلية وتجزئتها. ثم، باستخدام ترانسكريبتاسيس العكسي، يجب إعداد مكتبة [كدنا]. يجب أن يكون ليغاتد كل كدنا حبلا مع محولات. ثم يجب تضخيم الشظايا ليغاتد وتنقيته. أخيرا باستخدام طريقة نغس، يجب أن يتم تنفيذ تسلسل كدنا.

الشكل 02: تسلسل الحمض النووي الريبي

ما هو الفرق بين ميكروأري وتسلسل الحمض النووي الريبي؟

- ديف المادة قبل منتصف الجدول>>

ميكروأري مقابل تسلسل الحمض النووي الريبي
ميكروأري هو قوي وموثوق بها، طريقة عالية الإنتاجية.	تسلسل الحمض النووي الريبي هو طريقة دقيقة وعالية الإنتاجية.
التكلفة
هذه طريقة منخفضة التكلفة.	هذه طريقة مكلفة.
تحليل عدد كبير من العينات
هذا يسهل تحليل عدد كبير من العينات في وقت واحد.	هذا يسهل تحليل عدد كبير من العينات.
تحليل البيانات
تحليل البيانات معقد.	يتم إنشاء المزيد من البيانات في هذه الطريقة؛ وبالتالي، فإن العملية أكثر تعقيدا.
المعرفة السابقة من تسلسل
ويستند هذا الأسلوب على تحقيقات التهجين، لذلك معرفة مسبقة من تسلسل في المطلوبة.	هذه الطريقة لا تعتمد على معرفة التسلسل السابق.
الاختلافات الهيكلية والجينات الجديدة
هذا الأسلوب لا يمكن الكشف عن الاختلافات الهيكلية والجينات الجديدة.	هذا الأسلوب يمكن الكشف عن الاختلافات الهيكلية مثل الجينات الصمامات، الربط البديلة، والجينات الجديدة.
الحساسية
هذا لا يمكن الكشف عن الاختلافات في التعبير عن الأشكال الإسوية، لذلك هذا لديه حساسية محدودة.	هذا لديه حساسية عالية.
النتيجة
هذا يمكن أن يؤدي فقط إلى مستويات التعبير النسبي. هذا لا يعطي الكمي المطلق للتعبير الجيني.	ويعطي مستويات التعبير المطلق والنسبي.
تحليل البيانات
هذا يحتاج إلى إعادة تشغيل من أجل إعادة تحليل.	يمكن إعادة تحليل بيانات التسلسل.
الحاجة إلى موظفين معينين والبنية التحتية
ليست هناك حاجة إلى بنية تحتية محددة وموظفين ل ميكروأري.	بنية تحتية محددة وموظفين مطلوبين بواسطة تسلسل الحمض النووي الريبي.
تيشنيكال إيسويس
تقنية ميكروأري لديها قضايا تقنية مثل التهجين عبر، التهجين غير محددة، ومعدل الكشف المحدود من تحقيقات الفردية، الخ	تقنية رنا سيق تجنب القضايا الفنية مثل التهجين عبر، التهجين غير محددة، محدودة معدل الكشف عن تحقيقات فردية، وما إلى ذلك
التحيز
هذا هو أسلوب متحيز لأنه يعتمد على التهجين.	التحيز منخفض بالمقارنة مع ميكروأري.

ملخص - ميكرواراي مقابل تسلسل الحمض النووي الريبي

طرق التسلسل ميكروأري و رنا هي منصات إنتاجية عالية وضعت ل التنميط ترانسكريبتوم. كلا الطريقتين تنتج النتائج التي ترتبط إلى حد كبير لمحات التعبير الجيني. ومع ذلك، تسلسل الحمض النووي الريبي له مزايا على ميكروأري لتحليل التعبير الجيني. تسلسل الحمض النووي الريبي هو طريقة أكثر حساسية للكشف عن النصوص وفرة منخفضة من ميكروأري. تسلسل الحمض النووي الريبي أيضا تمكن من التمايز بين الأشكال الإسوية وتحديد المتغيرات الجينية. ومع ذلك، ميكروأري هو الخيار المشترك لمعظم الباحثين منذ تسلسل الحمض النووي الريبي هو تقنية جديدة ومكلفة مع البيانات تخزين التحديات وتحليل البيانات المعقدة.

المراجع:

1. وانغ، وتشونغ، ومارك جيرستين، ومايكل شنيدر. "رنا-سيق: أداة ثورية ل ترانسكريبتوميكس. "استعراض الطبيعة. علم الوراثة. المكتبة الوطنية للطب، يناير 2009. ويب. 14 مارس 2017

2. روجلر، تشارلز E.، تاتيانا تشايكوفسكايا، راكيل نوريل، ألدو ماسيمي، كريستوفر بليسيا، يوجيني روباشيفسكي، بول سيبرت، وليزلي إي روجلر. "رنا التعبير ميكروأرس (ريمس)، طريقة عالية الإنتاجية لقياس الاختلافات في التعبير الجيني في عينات بيولوجية متنوعة. "الأحماض النووية البحوث. مطبعة جامعة أكسفورد، 01 يناير 2004. ويب. 15 مارس 2017

3. تشاو، شانرونغ، واي بينغ فونغ ليونغ، أنطون بتنر، كارين نجو، و شيويون ليو. "مقارنة رنا-سيق و ميكروأري في التنميط ترانسكريبتوم من خلايا T المنشط. " بلوس واحد. المكتبة العامة للعلوم، يناير 2014. ويب. 15 مارس 2017

إيماج كورتيسي:

1. "مجلة. pcbi. 1004393. g002 "من قبل مالاشي غريفيث، جيسون ر. ووكر، نيكولاس C. سبيس، بنيامين J. إينسكوغ، أوبي L. غريفيث - (سيسي بي 2. 5) عن طريق كومونس ويكيميديا ​​

2. "ميكروأري" بي بيل برانسون (مصور) - المعهد الوطني للسرطان (المجال العام) عبر ويكومديا كومونس