الفرق بين نغس و سانجر التسلسل | نغس فس سانجر سيكنسينغ

الفرق الرئيسي - نغس مقابل تسلسل سانجر

التسلسل التالي للجيل (نغس) و سانجر التسلسل هو نوعان من تقنيات التسلسل النوكليوتيد المتقدمة على مر الزمن. سانجر طريقة التسلسل كان يستخدم على نطاق واسع لسنوات عديدة و نغس استبدالها مؤخرا بسبب مزاياه. والفرق الرئيسي بين نغس وسلسلة سانجر هو أن تعمل نغس على مبدأ تسلسل الملايين من تسلسل في وقت واحد بطريقة سريعة من خلال نظام التسلسل في حين أن سانجر التسلسل يعمل على أساس إنهاء سلسلة بسبب دمج انتقائي من ديديوكسينوكليوتيدس بواسطة انزيم البلمرة الحمض النووي خلال تكرار الحمض النووي وما ينتج عن ذلك من فصل الانفصال عن طريق الكهربائي الشعري.

المحتويات

1. نظرة عامة والفرق الرئيسي

2. ما هو تسلسل النيوكليوتيد

3. ما هو نغس

4. ما هو سانجر التسلسل

5. جنبا إلى جنب مقارنة - نغ مقابل فس سانجر التسلسل

6. ملخص

ما هو تسلسل النيوكليوتيد؟

يتم تخزين المعلومات الوراثية في تسلسل النوكليوتيدات من الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي للكائن الحي. تعرف عملية تحديد الترتيب الصحيح للنيوكليوتيدات (باستخدام أربع قواعد) في جزء معين (في الجينات، ومجموعة من الجينات، والكروموسوم، والجينوم الكامل) بتسلسل النوكليوتيدات . ومن المهم جدا في الدراسات الجينومية، والدراسات الجنائية، علم الفيروسات، والمنهجية البيولوجية، والتشخيص الطبي، والتكنولوجيا الحيوية، وفي العديد من المجالات الأخرى لتحليل هيكل ووظيفة الجينات. هناك أنواع مختلفة من أساليب التسلسل التي وضعها العلماء. من بينها، سانجر تسلسل التي وضعتها فريدريك سانجر في عام 1977 استخدمت على نطاق واسع وشعبية لفترة طويلة حتى الجيل القادم التسلسل استبدالها.

ما هو نغس؟

تسلسل الجيل التالي (نغس) هو مصطلح يستخدم للإشارة إلى عمليات التسلسل عالية الإنتاجية الحديثة. وهو يصف عددا من تقنيات التسلسل الحديثة المختلفة التي أحدثت ثورة في الدراسات الجينية والبيولوجيا الجزيئية. هذه التقنيات هي تسلسل إلومينا، تسلسل روه 454، تسلسل أيون بروتون و سوليد (تسلسل بواسطة أوليغو ربط كشف) التسلسل. أنظمة نغس هي أسرع وأرخص. وتستخدم أربعة أساليب تسلسل الحمض النووي الرئيسية في نظم نغس وهي؛ بايروسكنسينغ، والتسلسل عن طريق التوليف، والتسلسل عن طريق ربط وتسلسل أشباه الموصلات أيون. عدد كبير من الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي الخيوط (الملايين من) يمكن أن تتسلسل بالتوازي. فإنه يسمح تسلسل الجينوم بأكمله من الكائنات الحية في غضون فترة زمنية قصيرة، على عكس التسلسل سانجر الذي يستغرق المزيد من الوقت.

نغس لديها العديد من المزايا على التسلسل التقليدي طريقة سانجر. بل هو سرعة عالية، وأكثر دقة وعملية فعالة من حيث التكلفة التي يمكن أن يؤديها مع حجم العينة الصغيرة. نغس يمكن استخدامها في الدراسات ميتاجينوميك، في الكشف عن الاختلافات داخل الجينوم الفردية بسبب الإدراج والحذف وما إلى ذلك وفي تحليل تعبيرات الجينات.

الشكل_1: التطورات في تسلسل نغس

ما هو التسلسل سانجر؟

سانجر التسلسل هو طريقة التسلسل التي وضعها فريدريك سانجر وزملاؤه في عام 1977 لتحديد النظام النوكليوتيدات دقيقة من جزء الحمض النووي معين. ومن المعروف أيضا باسم تسلسل إنهاء السلسلة أو تسلسل ديديوكسي . مبدأ العمل من هذه الطريقة هو إنهاء تخليق حبلا عن طريق دمج انتقائي من سلسلة ديديوكسينوكلأوتيدس تنتهي (دتبس) مثل دغتب، دكب، داتب و دتب عن طريق دنا البلمرة خلال تكرار الحمض النووي. النيوكليوتيدات العادية لديها 3 'مجموعات أوه لتشكيل السندات فوسفهوديستر بين النوكليوتيدات المجاورة لمواصلة تشكيل حبلا. ومع ذلك، دنتبس تفتقر إلى هذا 3 'مجموعة أوه وغير قادرين على تشكيل السندات فوسفهوديستر بين النيوكليوتيدات. وبالتالي، توقف استطالة السلسلة.

في هذه الطريقة، الحمض النووي تقطعت بهم السبل واحد ليكون التسلسل بمثابة حبلا قالب في المختبر تخليق الحمض النووي. المتطلبات الأخرى هي أوليغونوكليوتيد التمهيدي، السلائف ديوكسينوكليوتيد وانزيم البلمرة الحمض النووي. عندما نهايات المرافقة من شظية الهدف معروفة، الاشعال يمكن أن تكون مصممة بسهولة لتكرار الحمض النووي. يتم تنفيذ أربعة ردود فعل توليف الحمض النووي منفصلة في أربعة أنابيب منفصلة. كل أنبوب لديه دنتبس منفصلة، ​​جنبا إلى جنب مع متطلبات أخرى. من النوكليوتيدات معينة، يتم إضافة خليط من دنتبس و دنتبس. وبالمثل، يتم تنفيذ أربعة ردود فعل منفصلة في أربعة أنابيب مع أربعة مخاليط. بعد ردود الفعل، يتم الكشف عن شظايا الحمض النووي وتحويل نمط جزء إلى معلومات تسلسل. شظايا الحمض النووي الناتجة هي التشويه والتشويه الحرارة وفصلها بالهلام الكهربائي. إذا تم استخدام النيوكليوتيدات المشعة، ونمط النطاقات في هلام بولي أكريلاميد يمكن تصور عن طريق التصوير الشعاعي الذاتي. عندما يستخدم هذا الأسلوب ديديوكسينوكليوتيدس الموسومة فلورزنتلي، فإنه يمكن التخفيف من أسفل هلام القراءة ومرت من خلال شعاع الليزر ليتم الكشف عنها من قبل كاشف الفلورسنت. لتجنب الأخطاء التي قد تنشأ عند قراءة تسلسل من قبل العين وتدخل يدويا في جهاز كمبيوتر، وضعت هذه الطريقة في استخدام الآلي المنظم إلى جانب الكمبيوتر.

هذه هي الطريقة المستخدمة لتسلسل الحمض النووي من مشروع الجينوم البشري. هذه الطريقة لا تزال قيد الاستخدام مع التعديلات المتقدمة لأنه يعطي معلومات تسلسل دقيقة على الرغم من كونها عملية باهظة الثمن وبطيئة.

figure_2: سانجر التسلسل

ما هو الفرق بين نغس وسلسلة سانجر؟

- ديف المادة قبل الجدول ->

نغ مقابل تسلسل سانجر
يشير تسلسل الجيل التالي (نغس) إلى عمليات تسلسل الإنتاجية العالية الحديثة.وهو يصف عددا من مختلف تقنيات التسلسل الحديثة	سانجر التسلسل هو طريقة التسلسل التي وضعتها فريدريك سانجر لتحديد النظام النوكليوتيدات دقيقة من جزء الحمض النووي معين.
فعالية التكلفة
تعتبر عملية تحويل الغاز الطبيعي (نغس) عملية أرخص لأنها تقلل من الوقت، والطاقة البشرية، والمواد الكيميائية.	هذا هو عملية مكلفة لأنه يأخذ الوقت، رجل السلطة والمزيد من المواد الكيميائية.
سرعة
هذا هو أسرع منذ كل من الكشف عن المواد الكيميائية والكشف عن إشارة من العديد من فروع تحدث بالتوازي.	هذا يستغرق وقتا طويلا منذ الكشف عن المواد الكيميائية والكشف عن إشارة يحدث ك عمليتين منفصلتين وفقط على حبلا يمكن قراءة في وقت واحد.
الموثوقية
نغس موثوق بها.	سانجر التسلسل أقل موثوقية
حجم العينة
يتطلب نغس كمية أقل من الحمض النووي.	هذا الأسلوب يحتاج إلى كمية كبيرة من الحمض النووي القالب.
قواعد الحمض النووي لكل جزء متسلسل
عدد قواعد الحمض النووي لكل شظية متسلسلة أقل من طريقة سانجر	تسلسل توليد أطول من تسلسل نغس.

ملخص - نغس فس سانجر التسلسل

نغس و سانجر التسلسل هي تقنيات تسلسل النوكليوتيدات المستخدمة على نطاق واسع في البيولوجيا الجزيئية. تسلسل سانجر هو طريقة التسلسل المبكر الذي حل محله نغس. والفرق الرئيسي بين نغس وسلسلة سانجر هو أن نغس هي عملية عالية السرعة، وأكثر دقة وفعالة من حيث التكلفة من سانجر التسلسل. وأسفرت كلتا التقنيتين عن تفشي كبير في علم الوراثة والتكنولوجيا الحيوية.

المرجع:

1. نوروزيان، مينو. "تقنيات تسلسل الجيل التالي للكائنات الحية الدقيقة الأوكاريوتية: الحلول القائمة على التسلسل للمشاكل البيولوجية. " خلية حقيقية النواة. الجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة، أيلول / سبتمبر 2010. ويب. 18 فبراير 2017

2. سانجر، F.، S. نيكلن، و A. R. كولسون. "تسلسل الحمض النووي مع مثبطات إنهاء السلسلة. "وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم 74. 12 (1977): 5463-467. على شبكة الإنترنت.

3. ليو، لين، ينهو لي، سيليانغ لي، ني هو جين تاو، يى مين هو، راي بونغ، ​​داني لين، ليهوا لو، وماغي لو. "مقارنة بين الجيل التالي من أنظمة التسلسل. "مجلة الطب الحيوي والتكنولوجيا الحيوية 2012 (2012): 1-11. على شبكة الإنترنت.

إيماج كورتيسي:

"سانغر-سيكنسينغ" بي إستيفيزج - عمل خاص (سيسي بي-سا 3. 0) من خلال كومونس ويكيميديا ​​

"التطورات في تسلسل الجيل القادم" بواسطة نيديربراغت، ليكس (2012) سيسي بي 3. 0) عبر ويكومديا كومونس